许多学者认为，约翰福音 1.40中提到的门徒可能就是这卷福音书的作者，即使徒约翰。这一假设得到以下事实的印证：约翰在自己的福音书中从不明确提及自己的名字，而是用“耶稣所爱的那门徒”这个说法来称呼自己。这样，他在整个叙述中都保持低调。
约翰福音 13.23：在最后的晚餐上，约翰被描述为靠近耶稣。
约翰福音 19.26-27：在十字架下，耶稣把自己的母亲托付给这位门徒。
约翰福音 20.2：抹大拉的马利亚跑去告诉“耶稣所爱的那门徒”和彼得空坟墓的事。
约翰福音 21.7：复活之后，这位门徒在岸边认出了耶稣。
约翰福音 21.20-24：耶稣与彼得的一次对话中提到了这位门徒。
“耶稣所爱的那门徒”这个说法并不意味着其他门徒被爱得较少。所有人都同样被爱，每个人都可以这样形容自己。彼得提到这种联系，是出于他的细腻敏感。
约翰福音 1.40中的匿名可以用与这些例子类似的方式来理解。
一些学者提出，这位匿名门徒是腓力。这一假设基于约翰福音 1.43中腓力的蒙召，表明之前可能有过一次相遇。这一背景可与利未的蒙召（马太福音 9.9-13）相比较，那里也有人提出此前曾有过相遇，尽管没有具体证据。
因此，很难在约翰和腓力之间做出选择。然而，由于约翰在十二门徒群体中是重要的门徒，我们更倾向于约翰。我们认为他的见证与安得烈、彼得、腓力和拿但业的见证同样具有分量。如果这位门徒是腓力，我们就会缺少关于使徒约翰的信息，而他在使徒群体中占据着首要地位。