Veel onderzoekers menen dat de discipel die in Johannes 1:40 wordt genoemd, de schrijver van dit Evangelie kan zijn, namelijk de apostel Johannes. Deze hypothese wordt ondersteund door het feit dat Johannes zichzelf in zijn eigen Evangelie nooit uitdrukkelijk noemt; hij verwijst naar zichzelf met de uitdrukking “de discipel van wie Jezus hield”. Zo neemt hij in zijn hele verslag een bescheiden houding aan.
Johannes 13.23: Tijdens het laatste avondmaal wordt Johannes beschreven als dicht bij Jezus.
Johannes 19.26-27: Aan de voet van het kruis vertrouwt Jezus zijn moeder toe aan deze discipel.
Johannes 20.2: Maria Magdalena rent om “de discipel van wie Jezus hield” en Petrus op de hoogte te brengen van het lege graf.
Johannes 21.7: Deze discipel herkent Jezus op de oever na de opstanding.
Johannes 21.20-24: In een gesprek tussen Jezus en Petrus wordt deze discipel genoemd.
De uitdrukking “de discipel van wie Jezus hield” betekent niet dat de andere discipelen minder geliefd waren. Allen werden op dezelfde manier liefgehad, en ieder had zichzelf zo kunnen beschrijven. Petrus noemt deze band vanwege zijn gevoeligheid.
De anonimiteit in Johannes 1.40 kan op soortgelijke wijze worden uitgelegd als deze voorbeelden.
Sommige onderzoekers stellen voor dat deze anonieme discipel Filippus is. Deze hypothese is gebaseerd op de roeping van Filippus in Johannes 1.43, die op een mogelijke eerdere ontmoeting wijst. Deze context kan worden vergeleken met de roeping van Levi (Matteüs 9.9-13), waarbij ook is gesuggereerd dat er eerder een ontmoeting had plaatsgevonden, zij het zonder concrete bewijzen.
Het is dus moeilijk te kiezen tussen Johannes en Filippus. Onze voorkeur gaat echter uit naar Johannes vanwege zijn status als belangrijk discipel binnen de groep van de twaalf. Zijn getuigenis lijkt ons even relevant als dat van Andreas, Petrus, Filippus en Natanaël. Als deze discipel Filippus zou zijn, zouden we informatie missen over de apostel Johannes, die een vooraanstaande positie inneemt binnen de groep van de apostelen.