מרטין לותר מת ב-18 בפברואר 1546 באייזלבן, עיר הולדתו, בעת ששהה שם בשליחות כדי ליישב מחלוקת בין שני אחים. להלן כמה פרטים על שעותיו האחרונות:
השעות האחרונות: לותר בילה את שעותיו האחרונות בצלילות דעת ובהכרה. הוא התוודה על חטאיו וחזר ואישר את אמונתו במשיח, כפי שלימד לאורך כל חייו.
תחושה מקדימה: בשבועות שקדמו למותו נראה שלותר חש מראש את מותו שלו. הוא דיבר לא אחת על המוות כעל המשווה בין כולם, והדגיש שהמוות אינו עושה הבחנה בין עשירים לעניים.
מוות טבעי: בניגוד לשמועות של זמנו, לותר לא מת פתאום ולא באימה. מותו תועד בפירוט בידי מוודהו, יוסטוס יונאס, כדי להפריך את עלילותיהם של מתנגדיו הקתולים.
השפעה לאחר המוות: מותו של לותר סימן את סופה של תקופה, אך מורשתו נמשכה באמצעות וכתביו, שממשיכים להשפיע על התאולוגיה והתרבות הנוצריות.